O Setor de Animação Pastoral fortalece a identidade confessional da Educação Católica por meio do aprofundamento da missão evangelizadora da escola/ universidade. Por meio de uma formação continuada, de eventos, cursos, projetos e outras iniciativas, procuramos fazer com que os agentes de pastoral, educadores e gestores se configurem como verdadeiros evangelizadores. A ANEC visa, assim, multiplicar o Reino de Deus no vasto campo da Educação, mantendo vivos os valores do humanismo solidário e da formação integral da pessoa humana, de acordo com o Evangelho de Jesus Cristo. A Pastoral é compreendida pela ANEC não como um anexo das instituições, mas como eixo unificador da confessionalidade que se expressa no compromisso de uma educação academicamente qualificada e humanizadora e que exige um trabalho organizado, sistematizado e estratégico. O Setor de Animação Pastoral da ANEC mantém um estreito relacionamento com os organismos da Igreja em sinal de comunhão e participação.